LES PUCES À ADN POUR ÉTUDIER L'EXPRESSION DES GÈNES
Ces puces à ADN, dites « puces Transcriptome », permettent d’analyser et de quantifier l’expression des gènes sous forme d’ARN messagers qui, après traduction, vont permettre la production des protéines indispensables au fonctionnement de la cellule normale ou tumorale. L’ensemble de ces ARN messagers constitue ce que l’on appelle le transcriptome.
Les puces à ADN , utilisées pour la conduite des projets dans le cadre du programme CIT, sont des puces commerciales Affymetrix. Ces puces offrent la possibilité d’étudier l’expression de plus de 30 000 gènes dans chaque tumeur étudiée (puce HG U133 2+).
L’analyse du transcriptome des tumeurs, grâce à ces puces, est effectuée sur la plate-forme génomique de Strasbourg (responsable Philippe Kastner, IGBMC).
Exemple de résultatsf ournis par une puce ADN transcriptome
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La puce transcriptome permet de classer les tumeurs en fonction de l’expression des gènes
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